- 產品介(jiè)紹
XM-Q800R3聚能(néng)式超(chāo)聲(shēng)DNA剪切儀是小美(měi)超(chāo)聲公(gōng)司是(shì)國內較早(zǎo)為CHIP實驗(yàn)（染色質免(miǎn)疫共沉(chén)澱(diàn)—一種研究(jiū)蛋(dàn)白與DNA相(xiāng)互(hù)作用的技(jì)術）而設計的(dí)，整套(tào)設備由一(yī)體(tǐ)式主機，聚(jù)能式(shì)換(huàn)能器，杯(bēi)式探(tàn)頭(tóu)，樣品(pǐn)支架(jià)，可透(tòu)視消音箱(xiāng)和冷(lěng)卻(què)水循(xún)環機等幾個(gè)部分組成(chéng)。經二代測序儀Illumina廠(chǎng)家實(shí)驗(yàn)室測試使用，設(shè)備的性能和(hé)實(shí)驗(yàn)結果非(fēi)常好，媲美進口產品(pǐn)。
全(quán)基因組測(cè)序(xù)（Whole Genome Sequencing, WGS）是基(jī)因組較(jiào)為多(duō)的研(yán)究(jiū)方案。WGS通過對(duì)人類(lèi)細胞中的基因(yīn)組（包(bāo)括(kuò)綫(xiàn)粒(lì)體(tǐ)）所有(yǒu)的(dí)30億鹼基(jī)進行測序(xù)，測定(dìng)其DNA的鹼基序列(liè)，從(cóng)而(ér)可在(zài)全基因組(zǔ)水平上檢(jiǎn)測與人(rén)類疾(jí)病相(xiāng)關(guān)的單核(hé)苷(gān)酸變異(SNVs)，插(chā)入(rù)缺失(shī)(In Dels)，拷(kǎo)貝數變異(yì)(CNVs)和結構(gòu)變異(yì)(SVs)等(děng)多種(zhǒng)突變(biàn)信息，進而得到(dào)完整的(dí)人體“說明書(shū)”。XM-Q800R3打(dǎ)斷(duàn)儀為(wéi)全(quán)基因提(tí)供(gōng)高效，均(jūn)一(yī)，穩(wěn)定的(dí)樣品(pǐn)前(qián)處(chǔ)理。
1.png)
- 應(yīng)用公司(sī)介紹(shào)
希(xī)望組(Grandomics）是三(sān)代測序(xù)大數據技(jì)術和(hé)應用的開拓者，成立於(yú)2011年(nián)8月8日，曾用“未來組(zǔ)”品牌開(kāi)拓三代測序(xù)科技服(fú)務(wù)，是三(sān)代(dài)測序服(fú)務(wù)公(gōng)司和三(sān)代(dài)測序大(dà)數據(jù)診斷(duàn)公司。
多(duō)年來(lái)，一直(zhí)專注於(yú)在三代(dài)測(cè)序平台上進行技(jì)術(shù)開(kāi)發(fā)與(yǔ)應(yīng)用拓展(zhǎn)，目(mù)前(qián)，已(yǐ)經形(xíng)成(chéng)了“科技(jì)服(fú)務”，“醫(yī)學診(zhěn)斷(duàn)”，“生物(wù)信息(xī)”，“先進(jìn)製造”四(sì)大(dà)業務模塊；在北(běi)京(jīng)，武漢(hàn)建設了(liǎo)合計超過(guò)5,000平米的科(kē)研服務平(píng)台，醫學檢(jiǎn)驗實(shí)驗室(shì)；引(yǐn)進了國(guó)際(jì)先進(jìn)的ONT PromethION 48，PacBio Sequel II，MGISEQ2000/T7，Bionano Saphyr光學圖(tú)譜等技術平(píng)台(tái)。
2.png)
非接觸式(shì)DNA打斷是全基因(yīn)組(zǔ)測序的前處理步驟，打斷效果是(shì)否(fǒu)均(jūn)一(yī)，穩(wěn)定，這關係著是(shì)否影響後續(xù)全(quán)基(jī)因(yīn)組序列(liè)的準(zhǔn)確性(xìng)。測試階(jiē)段客戶使(shǐ)用(yòng)參(cān)數為：4℃循(xún)環水。百(bǎi)分(fēn)100功率(shuài)，運(yùn)行(háng)10s，停(tíng)止10s，15分鐘(zhōng)打斷(duàn)效(xiào)果如下圖：agilent 2100測試結(jié)果表明時間(jiān)過長，均(jūn)一性不好(hǎo)。
經過(guò)調整後，效果提升。
4.png)
片5.png)
根據(jù)片(piàn)段(duàn)大小，可以調(tiáo)整不同(tóng)的實驗(yàn)時間(jiān)和(hé)功(gōng)率。
- 應(yīng)用展望
全(quán)基因(yīn)組測(cè)序(xù)基本上在所(suǒ)有(yǒu)三(sān)代(dài)測序(xù)這(zhè)個(gè)都(dū)有(yǒu)大範圍的應用，我司非(fēi)接(jiē)觸式DNA打斷儀有(yǒu)多(duō)種通量(liáng)和效(xiào)率可(kě)以選擇(zé)，XM-Q800R3是目前(qián)效率較高(gāo)，但(dàn)是(shì)通量(liáng)較(jiào)小的(dí)一(yī)款(kuǎn)設備，通(tōng)過(guò)與未(wèi)來(lái)組的合(hé)作應用，我們(mén)將(jiāng)加速(sù)研(yán)發(fā)改進設(shè)備的(dí)應(yīng)用，使(shǐ)其更加(jiā)匹(pǐ)配到(dào)全(quán)基因組測序(xù)的(dí)服(fú)務(wù)中(zhōng)。