實驗目的(dí)：將(jiāng)全基因組DNA樣品(pǐn)進行100-500bp區(qū)間(jiān)的片(piàn)段化(huà)處(chǔ)理。
實驗儀(yí)器及材料：
1.實驗儀(yí)器(qì)：小(xiǎo)美(měi)超聲(shēng)-高(gāo)通(tōng)量(liáng)超聲(shēng)波基(jī)因組(zǔ)剪切(qiē)儀(yí)
2.實驗(yàn)材(cái)料：核酸濃(nóng)度為12ng/μL的(dí)全基因(yīn)組(zǔ)DNA溶液
基(jī)因組樣(yàng)品DNA超(chāo)聲打(dǎ)斷的(dí)實(shí)驗(yàn)步驟(zhòu)：
1.提(tí)前15分鐘將(jiāng)三款(kuǎn)儀器的冷(lěng)水機啟動，設置溫度為4℃。
2.將每個0.2mL EP管(guǎn)加(jiā)入130 μL 濃度為(wéi)12ng/μL的全(quán)基因組DNA溶液(yè)。
3.將2管裝(zhuāng)好(hǎo)樣(yàng)品(pǐn)的(dí)0.2mL EP 管(guǎn)分別放入儀器(qì)的適(shì)配(pèi)器當(dāng)中(zhōng)，其他空(kōng)餘(yú)的孔位由加同樣體積水的(dí)0.2mL EP 管補(bǔ)齊(qí)。
4.程序設置：溫度4℃，超聲(shēng)工作時間20s間(jiān)隔時(shí)間10s，總(zǒng)時(shí)長分(fēn)別為(wéi)3分鐘和4分(fēn)鐘。
5.程(chéng)序結(jié)束後(hòu)，取出(chū)樣品使(shǐ)用毛(máo)細管電(diàn)泳進行基因(yīn)組片(piàn)段化檢(jiǎn)測(cè)。
基因組(zǔ)樣品DNA超聲打斷(duàn)的實驗(yàn)結(jié)果：
1.小美超(chāo)聲(shēng)-高(gāo)通量超聲(shēng)波(bō)基因組剪切儀(yí) 程序一：
①程序設置：溫度(dù)4℃，超(chāo)聲工作時間(jiān)20s 間隔(gé)時間10s，總(zǒng)時(shí)長3分(fēn)鐘
平(píng)均片段(duàn)大小(xiǎo)：288 bp, 101-503 bp區間(jiān)占比(bǐ) 83.64%。
2.小美超(chāo)聲(shēng)-高(gāo)通(tōng)量(liáng)聲波基(jī)因組(zǔ)剪切儀 程序(xù)二(èr)：
②程(chéng)序設(shè)置(zhì)：溫(wēn)度(dù)4℃，超聲(shēng)工(gōng)作時間(jiān)20s 間(jiān)隔10s，總時長4分鐘(zhōng)
平(píng)均(jūn)片段大小：266 bp，99-503 bp區間(jiān)占比 89.33%。
3.實驗結果匯總：
在(zài)樣品(pǐn)，超(chāo)聲(shēng)程序設(shè)定(dìng)等(děng)條(tiáo)件(jiàn)相同的情況(kuàng)下，使(shǐ)用小(xiǎo)美超聲(shēng)的(dí)高(gāo)通量聲波基因組(zǔ)剪切(qiē)儀(yí)在3分(fēn)鐘(zhōng)和(hé)4分鐘時，100-500 bp區間占(zhān)比分(fēn)別為83.64%和89.33%，且(qiě)二(èr)者(zhě)峰圖(tú)呈(chéng)平(píng)緩狀(zhuàng)，表(biǎo)明基因(yīn)組片段(duàn)均(jūn)一性(xìng)良好(hǎo)。