在NGS檢測實(shí)驗(yàn)中(zhōng)，DNA文庫構(gòu)建的第一(yī)步(bù)就是將DNA隨(suí)機打(dǎ)斷(duàn)成符(fú)合(hé)各測序(xù)平(píng)台讀長(cháng)的(dí)片段。相信熟(shú)悉NGS文(wén)庫構建(jiàn)的科(kē)研(yán)人(rén)員一(yī)定糾結過這個(gè)問題(tí)，是(shì)用(yòng)酶(méi)解打(dǎ)斷還是(shì)超聲(shēng)波(bō)打斷(duàn)？
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目前(qián)DNA打斷的主(zhǔ)要(yào)的方(fāng)法(fǎ)是超(chāo)聲法和酶(méi)解(jiě)法(fǎ)。但(dàn)是這(zhè)兩種(zhǒng)方(fāng)法在實際(jì)使用中各(gè)具(jù)優勢，需(xū)要根據實(shí)驗者(zhě)自身的情況(kuàng)進行(háng)選擇(zé)。
超聲(shēng)波打(dǎ)斷(duàn)法：
1.操(cāo)作簡單(dān)，耗(hào)時短，成本低；
2.剪(jiǎn)切效果不受(shòu)DNA濃度(dù)影(yǐng)響，
3.隨機片段(duàn)化，無GC序列偏好(hǎo)；
4.片段化結(jié)果集(jí)中度(dù)高，目(mù)的(dí)長度(dù)片段得率高。
酶解法：
1.實驗要求嚴(yán)格(gé)，針對(duì)不(bù)同(tóng)樣(yàng)本合(hé)適的(dí)片段化(huà)條件(jiàn)摸索不易，成(chéng)本(běn)較(jiào)高(gāo)；
2.存在序(xù)列偏(piān)好性(xìng)；需要(yào)根(gēn)據樣本濃度(dù)改變酶濃(nóng)度，酶(méi)活(huó)性易(yì)受(shòu)到溶(róng)液成(chéng)分(fēn)影(yǐng)響；
3.目標長(cháng)度(dù)片段集(jí)中度較(jiào)低。
由(yóu)上可見(jiàn)超聲打斷(duàn)法(fǎ)的(dí)優勢(shì)顯而易(yì)見(jiàn)，但常用(yòng)的(dí)超聲(shēng)波(bō)打(dǎ)斷儀分(fēn)為接觸(chù)式(shì)和非接觸(chù)式(shì)。相比傳(chuán)統的(dí)探(tàn)頭超聲波(bō)破(pò)碎儀，探(tàn)頭與(yǔ)樣(yàng)品直接(jiē)接觸，一(yī)次隻能處(chǔ)理(lǐ)一個樣品(pǐn)，實(shí)驗(yàn)周期長(cháng)。而小(xiǎo)美(měi)非接(jiē)觸超聲波DNA打斷儀產品卻可在(zài)密閉容(róng)器下(xià)進行破碎(suì)，不產生感染性飛(fēi)霧(wù)，超聲(shēng)探(tàn)頭(tóu)與樣品不接觸，避免交叉汙染(rǎn)。
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對(duì)於每天要處理多個(gè)樣品或者貴重樣品的(dí)實驗室，小美非接(jiē)觸(chù)DNA超聲(shēng)波(bō)打(dǎ)斷儀具(jù)有通量高，實(shí)驗(yàn)一致性好(hǎo)，實驗重(zhòng)復性好(hǎo)，片段得(dé)率高，樣(yàng)本(běn)低(dī)損耗(hào)，無交叉(chā)汙染等(děng)優點。
一(yī)次(cì)多可同時處(chǔ)理32-64個(gè)樣(yàng)品(pǐn)，實(shí)驗(yàn)效(xiào)率高。專為二代測(cè)序(xù)DNA樣(yàng)本(běn)與染色質免疫共沉澱(diàn)實驗樣本前(qián)處(chǔ)理(lǐ)量(liáng)身(shēn)訂(dìng)做(zuò)的(dí)。
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采用(yòng)等溫(wēn)，非(fēi)接(jiē)觸的(dí)方式對(duì)樣(yàng)品進(jìn)行(háng)打斷，匀漿(jiāng)和混合；可用於超(chāo)微(wēi)量破碎(suì)，隔(gé)著(zhuó)離(lí)心(xīn)管(guǎn)能(néng)打斷染(rǎn)色(sè)體(tǐ)。深受各(gè)大基(jī)因(yīn)公司(sī)，生物(wù)公司(sī)，測序公司的好(hǎo)評(píng)！
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如何做好(hǎo)一(yī)個(gè)實(shí)驗，選擇往(wǎng)往比努力更(gēng)重(zhòng)要(yào)。小美非(fēi)接觸(chù)超聲(shēng)波DNA打斷(duàn)儀，讓你(nǐ)實驗(yàn)事半功(gōng)倍的(dí)科(kē)研好物(wù)！