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表觀(guān)遺傳學(xué)|ChIP非(fēi)接(jiē)觸式超聲(shēng)處理法

在(zài)基(jī)因調(tiáo)控(kòng)領域,表(biǎo)觀遺(yí)傳學一(yī)直(zhí)是(shì)比(bǐ)較熱門的話題,而染色質免疫沉(chén)澱(diàn) (ChIP) 是(shì)表觀遺(yí)傳(chuán)學中一(yī)項(xiàng)常用的技術。利用 ChIP,研究(jiū)人(rén)員可(kě)在整個基(jī)因(yīn)組內(nèi)識別(bié)目(mù)的蛋白結合的(dí)特(tè)定基(jī)因和序列(liè),為其(qí)調控(kòng)功能和機(jī)製(zhì)提供關(guān)鍵綫(xiàn)索(suǒ)。通過(guò)解(jiě)析(xī)蛋(dàn)白(bái)質(zhì)-DNA 相(xiāng)互作(zuò)用(yòng)的時(shí)間(jiān)和空間(jiān)動態(tài),ChIP 提(tí)供了(liǎo)對核(hé)心生物學過程(chéng)和(hé)疾病病理學(xué)的(dí)見(jiàn)解。

與大多數實(shí)驗方(fāng)法相同(tóng),ChIP也(yě)遵(zūn)循(xún)著GIGO原(yuán)則。如(rú)果你的(dí)染色質(zhì)原材(cái)料不(bù)佳(jiā),是很(hěn)難得(dé)到(dào)理想的(dí)實(shí)驗(yàn)結(jié)果(guǒ)的。同(tóng)時(shí),如果你的原材(cái)料(liào)OK,下一(yī)步(bù)片段化處理沒有(yǒu)做好,仍然是徒(tú)勞(láo)。目前我(wǒ)們(mén)一般(bān)通過超聲或(huò)者酶切將(jiāng)染(rǎn)色(sè)質片斷(duàn)打成(chéng)幾(jī)百(bǎi)Bp,但普通超(chāo)聲破碎儀很(hěn)難拿(ná)捏。超聲時間過長或力(lì)度過強都(dū)會令蛋(dàn)白變(biàn)性(xìng),使(shǐ)其與(yǔ)核酸分離(lí)或者(zhě)破壞(huài)抗體識別的抗原(yuán)表位。這(zhè)種(zhǒng)方案需(xū)要(yào)進(jìn)行大量的優化(huà),而傳統的探(tàn)頭超(chāo)聲波(bō)破(pò)碎(suì)儀(yí),探頭與樣品(pǐn)直(zhí)接接觸,一次(cì)隻能(néng)處理一(yī)個樣(yàng)品,實驗(yàn)周期(qī)長。對於多個樣品(pǐn),需要重(zhòng)復使(shǐ)用(yòng)同一探(tàn)頭,容(róng)易造成(chéng)樣(yàng)品交叉汙染。由於(yú)每(měi)次(cì)探(tàn)頭插入樣(yàng)品(pǐn)的(dí)深度(dù)不(bù)同,每次(cì)超(chāo)聲(shēng)的能量分布也不盡(jìn)相同,影(yǐng)響(xiǎng)實(shí)驗結(jié)果的重(zhòng)復(fù)性和準(zhǔn)確性。此(cǐ)外,由(yóu)於不能采用封(fēng)閉係統,在超(chāo)聲過(guò)程中(zhōng)產生(shēng)的氣(qì)霧或(huò)者泡(pào)沫會擴散(sàn)到環(huán)境(jìng)中,造成(chéng)潛在的生物危險。

而小(xiǎo)美XM-150A非接(jiē)觸式超(chāo)聲波(bō)破碎儀(DNA打斷儀),一(yī)次多可同時處理(lǐ)32個樣(yàng)品,把(bǎ)復(fù)雜的(dí)多(duō)參數影(yǐng)響直觀數據化,解(jiě)決了繁(fán)雜(zá)的(dí)參數(shù)誤差(chà),做到(dào)準(zhǔn)確(què)可(kě)控(kòng)效率(shuài)高;無(wú)需頻(pín)繁操(cāo)作探頭,各(gè)樣品均在(zài)單(dān)獨的全封閉(bì)試管中,避(bì)免交叉(chā)汙(wū)染,也(yě)不會產(chǎn)生感染性飛(fēi)沫;采用(yòng)4℃水浴超(chāo)聲波,能量(liáng)分布(bù)均(jūn)匀,超(chāo)聲作用完(wán)全(quán);超(chāo)聲參數(shù)設(shè)置靈活,實驗(yàn)步驟(zhòu)標(biāo)準化,實驗(yàn)重(zhòng)復(fù)性好,結果可靠性(xìng)高。

XM-150A非(fēi)接觸(chù)超聲波破(pò)碎儀(yí)主要用於細菌細(xì)胞(bāo)破(pò)碎(suì),蛋白質抽提,二(èr)代(dài)測(cè)序(xù)樣本 DNA 片段化(huà),免(miǎn)疫共(gòng)沉澱實驗,黴(méi)菌孢子破碎(suì),乳(rǔ)化,均(jūn)質(zhì),加(jiā)速溶解(jiě),催(cuī)化反應。它(tā)是利用磁(cí)致伸(shēn)縮共振(zhèn)超(chāo)聲技(jì)術(shù)破碎(suì)樣(yàng)本(běn), 核酸樣本破碎大(dà)小範圍為1kb~ 200bp 或更小(xiǎo)。這款超(chāo)聲(shēng)可(kě)持續工作(zuò)60分(fēn)鐘(zhōng),也(yě)可(kě)間(jiān)隙(xì)工(gōng)作(間(jiān)隙時間(jiān):0.1-999秒)。樣(yàng)品(pǐn)超(chāo)聲時(shí)能(néng)自(zì)動定速持(chí)續旋轉(zhuǎn),確保樣品破(pò)碎效果(guǒ)達到一致。還(huán)具有過熱保護功(gōng)能(néng)及(jí)溫(wēn)度監(jiān)測功能(néng),實驗(yàn)人員可放(fàng)心使用。

超(chāo)聲細胞(bāo)破碎(suì)機破碎(suì)氧化體粉末解決團(tuán)聚可(kě)行(háng)性報告
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雙通道非接觸超(chāo)聲波(bō)DNA打(dǎ)斷儀的(dí)應(yīng)用性能特(tè)點(diǎn)
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