實驗目的:生(shēng)物DNA樣本組(zǔ)織(zhī)的(dí)超(chāo)聲(shēng)打斷(duàn);對於(yú)一(yī)些動(dòng)植物(wù)組織(zhī)樣(yàng)本的(dí)實驗檢測,需要將(jiāng)其打(dǎ)斷(duàn)到200~300bp,再進行(háng)後續(xù)的實驗(yàn)測序分(fēn)析(xī)。
實驗(yàn)客戶:杭州(zhōu)聯川(chuān)生物技術股(gǔ)份有限公司,主要(yào)提(tí)供(gōng)二代測序(xù)科(kē)技服務,高通量芯片(piàn)表(biǎo)達譜分析,大(dà)數據生物信息(xī)分(fēn)析(xī)及軟件,高通量(liáng)寡核苷酸合成(chéng),分子生物學與臨床(chuáng)檢測試(shì)劑,以及VariantPro靶(bǎ)向(xiàng)文庫(kù)製備係(xì)統(tǒng)。
實驗設備(bèi):非(fēi)接(jiē)觸(chù)超(chāo)聲(shēng)波DNA打斷儀XM-150A雙通(tōng)道
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實驗操作步(bù)驟:
1.準備XM-150A單槽一台,冷(lěng)水機一台,0.1ml適(shì)配器一個,0.1ml離心管若幹(gān),需(xū)打(dǎ)斷的(dí)dna樣本若幹
2.將適(shì)配(pèi)器(qì)放(fàng)入水槽(cáo),打開冷(lěng)水機(jī)預冷至(zhì)4度(dù)
3.將稀釋(shì)好的dna樣(yàng)本每樣100微升(shēng)放(fàng)入0.65ml的離(lí)心(xīn)管(guǎn)蓋蓋編號(hào),震蕩離心(xīn)
4.將dna樣本(běn)放入(rù)適(shì)配器(qì)(注(zhù)意平麵配(pèi)平(píng),盡(jìn)量將樣(yàng)品放(fàng)置(zhì)在適配器外(wài)圈(quān),內圈(quān)同一樣(yàng)本重(zhòng)復放置(zhì)兩(liǎng)個(gè)進(jìn)行對比(bǐ))
5.能量設(shè)置100%,工(gōng)作20s間(jiān)隙10s循環工作,總(zǒng)時長14min
6.工作(zuò)完(wán)成後重復樣本取出(chū)一(yī)個,另一重復(fù)樣(yàng)本(běn)繼(jì)續能量設置100%,工(gōng)作20s間(jiān)隙(xì)10s循(xún)環(huán)工作,總(zǒng)時(shí)長3min
7.樣(yàng)本全部(bù)取(qǔ)出(chū),進行(háng)後續跑膠測(cè)試(shì)
樣(yàng)本(běn)準(zhǔn)備:
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樣(yàng)品處理(lǐ)完成:
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樣品實驗跑膠(jiāo)結(jié)果:
左側為(wéi)打(dǎ)斷總(zǒng)時(shí)長為(wéi)14min的(dí)樣品(pǐn),前兩個為外(wài)圈(quān)樣品;右側為(wéi)打斷總(zǒng)時(shí)長為(wéi)17min的樣(yàng)品(pǐn),前兩(liǎng)個為外圈樣(yàng)品(pǐn)
為更好地(dì)解決老師樣(yàng)本(běn)內外圈打斷不(bù)均一(yī)的(dí)實驗問題;此(cǐ)次實驗(yàn)更換調(tiáo)整(zhěng)了(liǎo)儀器內(nèi)的(dí)純(chún)水(shuǐ),設置(zhì)了不同時(shí)長的變(biàn)量,對結(jié)果並(bìng)無明(míng)顯(xiǎn)影響(xiǎng),後(hòu)續考慮再(zài)次測(cè)試儀(yí)器內(nèi)水位(wèi)高(gāo)低(dī)對樣品打(dǎ)斷結果(guǒ)的影響。
實(shí)驗操作(zuò)注(zhù)意(yì)事項:
1.樣(yàng)本的(dí)體積(jī)注(zhù)意(yì)不(bù)能過(guò)多,導(dǎo)致儀器內(nèi)水位不(bù)能完全沒過樣(yàng)品(pǐn)。
2.適配(pèi)器需要配平(píng),不能讓適配器(qì)壓蓋(gài)有所(suǒ)傾(qīng)斜,導(dǎo)致樣本(běn)開蓋(gài)汙染(rǎn)。
3.同(tóng)等條件下(xià)人體dna打(dǎ)斷難(nán)度大(dà)於(yú)小(xiǎo)鼠大(dà)於植物(wù),需要根據(jù)樣本調整(zhěng)儀器(qì)工作(zuò)總(zǒng)時長
4.冷水機(jī)需(xū)要(yào)提(tí)前(qián)打(dǎ)開預(yù)冷(lěng)
5.水流循環(huán)要(yào)調(tiáo)整穩(wěn)定(dìng)不能過(guò)於激烈(liè)